Data Set :

Name  dd_Smes_v2 Description  lab population sexual strain for genomic context
Designator  Rink lab Species  Schmidtea mediterranea Transcriptome for predicted gene
URL  http://planmine.mpi-cbg.de
 Feedback

740126 Bio Entities

Class Id
Organism . Name
Length Symbol Description Blast Target Species Blast Description evalue Contig Location Strand Source Domain Type InterPro Domain Description Length Symbol Domain Name Sequence Short Name Type
Assembly dd_Smes_v2 Schmidtea mediterranea S2F2                                          
DummyGene SMEST000001001.1gene Schmidtea mediterranea S2F2                             1385 SMEST000001001.1gene          
Contig SMEST000001001.1   1385 SMEST000001001.1               In silico gene prediction (AUGUSTUS v3.3)                      
DummyGene SMEST000003001.1gene Schmidtea mediterranea S2F2                             1939 SMEST000003001.1gene          
Contig SMEST000003001.1   1939 SMEST000003001.1               In silico gene prediction (AUGUSTUS v3.3)                      
DummyGene SMEST000010001.1gene Schmidtea mediterranea S2F2                             1531 SMEST000010001.1gene          
Contig SMEST000010001.1   1531 SMEST000010001.1               In silico gene prediction (AUGUSTUS v3.3)                      
DummyGene SMEST000013001.1gene Schmidtea mediterranea S2F2                             3424 SMEST000013001.1gene          
Contig SMEST000013001.1   3424 SMEST000013001.1               In silico gene prediction (AUGUSTUS v3.3)                      
DummyGene SMEST000017001.1gene Schmidtea mediterranea S2F2                             450 SMEST000017001.1gene          
Contig SMEST000017001.1   450 SMEST000017001.1               In silico gene prediction (AUGUSTUS v3.3)                      
DummyGene SMEST000022001.1gene Schmidtea mediterranea S2F2                             1072 SMEST000022001.1gene          
Contig SMEST000022001.1   1072 SMEST000022001.1               In silico gene prediction (AUGUSTUS v3.3)                      
DummyGene SMEST000023001.1gene Schmidtea mediterranea S2F2                             1242 SMEST000023001.1gene          
Contig SMEST000023001.1   1242 SMEST000023001.1               In silico gene prediction (AUGUSTUS v3.3)                      
DummyGene SMEST000025001.1gene Schmidtea mediterranea S2F2                             1867 SMEST000025001.1gene          
Contig SMEST000025001.1   1867 SMEST000025001.1               In silico gene prediction (AUGUSTUS v3.3)                      
DummyGene SMEST000026001.1gene Schmidtea mediterranea S2F2                             2484 SMEST000026001.1gene          
Contig SMEST000026001.1   2484 SMEST000026001.1               In silico gene prediction (AUGUSTUS v3.3)                      
DummyGene SMEST000031001.1gene Schmidtea mediterranea S2F2                             955 SMEST000031001.1gene          
Contig SMEST000031001.1   955 SMEST000031001.1               In silico gene prediction (AUGUSTUS v3.3)                      
DummyGene SMEST000033001.1gene Schmidtea mediterranea S2F2                             1474 SMEST000033001.1gene          
Contig SMEST000033001.1   1474 SMEST000033001.1               In silico gene prediction (AUGUSTUS v3.3)                      
DummyGene SMEST000041001.1gene Schmidtea mediterranea S2F2                             1289 SMEST000041001.1gene          
Contig SMEST000041001.1   1289 SMEST000041001.1               In silico gene prediction (AUGUSTUS v3.3)                      
DummyGene SMEST000042001.1gene Schmidtea mediterranea S2F2                             1193 SMEST000042001.1gene          
Contig SMEST000042001.1   1193 SMEST000042001.1               In silico gene prediction (AUGUSTUS v3.3)                      
DummyGene SMEST000044001.1gene Schmidtea mediterranea S2F2                             1022 SMEST000044001.1gene          
Contig SMEST000044001.1   1022 SMEST000044001.1               In silico gene prediction (AUGUSTUS v3.3)                      
DummyGene SMEST000046001.1gene Schmidtea mediterranea S2F2                             1320 SMEST000046001.1gene          

1 Data Source

Name URL
MPI-CBG http://www.mpi-cbg.de



To cite PlanMine, please refer to the following publication:

Rozanski, A., Moon, H., Brandl, H., Martín-Durán, J. M., Grohme, M., Hüttner, K., Bartscherer, K., Henry, I., & Rink, J. C.
PlanMine 3.0—improvements to a mineable resource of flatworm biology and biodiversity
Nucleic Acids Research, gky1070. doi:10.1093/nar/gky1070 (2018)